Можно было бы предположить о варианте, при котором Дофламинго оставил Морию в живых в своих каких-то целях. Но вряд ли Мории гордость бы позволила работать на Дофламингом. Да и в целом это все вилами по воде писано.
Чем меньше угадаешь в своих предположениях, тем интереснее повороты сюжета.)