Собственно, мысли по поводу зверей из Импел Дауна
Скорее всего, из-за того что пробуда у них пошла по одному месту, а именно потеря личности, её нельзя считать за полноценную, потому и облаков нет.
Только не объясняет случай Чоппера. Хотя может быть такое, что из-за наркоты он пробудил тоже неправильно, по аналогии с 4 гиром Луффи.